为了确保医院生物安全柜的有效运作，医护人员必须严格遵循一系列操作规程，这些规程旨在防止病毒、细菌和其他有害微生物的传播，并保护工作人员免受感染。以下是一些关键的操作步骤和建议，以帮助医护人员正确使用这些设备。
首先，所有使用生物安全柜的人员都应该接受适当的培训。这包括了解如何正确地打开和关闭柜门，以及如何通过合适的手臂或肩膀来操控其内部部件。他们还需要了解如何根据所处理材料的类型选择合适的过滤系统，并学习如何进行定期维护以确保设备始终处于良好状态。
第二，进入生物安全柜之前，医护人员应按照标准程序进行消毒。这个过程通常涉及穿戴个人防护装备（PPE），包括手套、面罩、眼镜以及可能的情况下完整服装。在某些情况下，还可能要求佩戴全身覆盖物或N95口罩。此外，他们还必须洗手并在进入前涂抹抗菌剂，以减少携带入侵性微生物进入环境中的风险。
第三，在工作时，医务人员应避免触摸任何不必要的地方，同时尽量减少对门把手等表面接触次数。如果必须与表面接触，那么应当用干净的手指轻按，而不是握住。如果需要将物品从外部带入或从内部取出，则应使用无菌工具，如铝箔夹子，或是经过充分消毒后再次封闭后的塑料袋。
第四，当执行实验室技术时，所有操作都应该保持简洁明了，不要多余不必要的手势，这样可以降低对环境中污染物质释放的风险。此外，如果工作涉及到处理高级别危险病原体（BSL-3/4），则需遵守更为严格的一系列规定，比如在每个实验结束后彻底清洁和灭活所有相关器械及试验材料，以及密切监控周围环境以确保没有泄漏发生。
第五，对于那些经常性的任务，可以考虑采用自动化系统来进一步提高效率并减少人为错误。但是，无论是否自动化，都要有一个详细记录日志程序，用以追踪每一次开放、关闭或者拆卸机器人的事件，以及与之相关的大型仪器组件更换周期，以便追溯分析任何潜在的问题。
最后，由于医疗机构中的生化研究活动非常频繁且不断变化，因此各项政策和程序也会随之更新。因此，每位参与者都应该定期参加更新培训，与同事分享最佳实践，并积极寻求改进措施以优化整个流程链条，从而增强整个医疗体系对于新挑战所做出的准备能力。
